Formations au diagnostic moléculaire des maladies émergentes bactériennes et virales

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  • Formateurs et stagiaires de la session de 2006 (25 sept - 6 oct)

Au programme du 1er stage de deux semaines :

  • des cours théoriques en bactériologie, virologie et techniques de diagnostic
  • des travaux dirigés sur quelques exemples de maladies émergentes (Begomovirus, Crinivirus), sur l’analyse des séquences oligonucléotidiques et sur la recherche de documents bibliographiques.
  • des visites sur le terrain pour observer et prélever des symptômes viraux (TYLCV et ToCV) et bactériens ( Xanthomonas sp. pv mangiferaeindicae, Xanthomonas axonopodis pv. allii).
  • des manipulations en laboratoire : extraction d’ADN total de plante, PCR, clonage, préparation de milieu...

Ce stage avait été initié en 2004 et portait à l'origine sur le diagnostic sérologique.

Les deux autres stages ont suivi en 2008 :

  • une semaine au mois de juin sur le diagnostic de Ralstonia solanacearum par PCR
  • une semaine début juillet sur l'utilisation des outils PCR multiplex :
    • une PCR multiplex sur tomate pour la détection de Ralstonia solanacearum et Clavibacter michiganensis subs. michiganensis
    • deux RT- PCR multiplex sur pomme de terre pour la détection du (i) PLRV et PVS ainsi que (ii) la détection du Ralstonia solanacearum, Clavibacter michiganensis subs. sepedonicus, PVX, PVA et PVY.

Formateurs :
Olivier PRUVOST, chercheur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Isabelle SOUSTRADE, chercheur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Daphné LINDERME, ingénieur phytopathologiste au CIRAD Réunion
Jean-Michel LETT, chercheur virologiste au CIRAD Réunion
Philippe PRIOR, chercheur phytopathologiste à l'INRA accueilli au CIRAD Réunion